Mal grob erklärt: Wenn das Bremssystem geöffnet ist (am Entlüfternippel) und du dann das Bremspedal durchtrittst, baut sich in dem Moment kein Druck im Druckraum des Bremszylinders auf, dementsprechend schiebst du den Kolben des Bremszylinders weiter rein als gewöhnlich. Die Primärmanschette, die normalerweise nun u.A. die Nachlaufbohrung abdichtet überfährt diese und wird beim lösen des Pedals in die Bohrungen geschoben und beschädigt. In Folge kann die Manschette nun nichts mehr abdichten und es kann kein Druck erzeugt werden - der Bremszylinder ist defekt.
Darum immer beachten -> beim entlüften niemals das Pedal bis zum Ende durchtreten. Am besten mit nem Gerät entlüften (lassen).