nach den VW-Service-Unterlagen für den Motor "AFT" ist die Codierung unterschiedlich je nach dem, ob der Motor mit einem Schalt- oder Automatikgetriebe kombiniert ist. Bei meinem Golf mit Motor "!AFT" und Automatikgetriebe ist es, soweit ich mich erinnere, mit "00002" codiert = Automatik.
Ich weiß, dass z.B. der Zündzeitpunkt des Motors durch das Automatik-Steuergerät beeinflusst wird, um Schaltvorgänge weicher ablaufen zu lassen. Hierzu greift das Automatikgetriebe bzw. sein Steuergerät elektrisch in das Motor-Steuergerät ein. Da dies bei einem Schaltgetriebe nicht passiert, vermute ich, dass z.B. diese Funktion beim Umprogrammieren des Motor-Steuergerätes auf "Schaltgetriebe" deaktiviert wird.
Wenn das Motor-Steuergerät mit der falschen Getriebeversion codiert ist, würde ich mit ungünstigeren Verbrauchs- und Fahrleistungswerten rechnen.