Vieleicht ist bei dir nur fälschlicher Weise Euro 1 bzw. E2 (nicht Euro 2) eingetragen. Der ADY hat meines Wissens immer Euro2 ab Werk.
Theoretisch kannst du mit dem Vermerk einfach zur Zulassungsstelle, die sollten damit was anfangen können und dir neue Papiere ausstellen. Du bekommst dann auch nachträglich die zuviel gezahlte Steuer zurück.
Einfach mal kurz bei deiner Zulassungsstelle anrufen.
Sollte der Vermerk nciht ausreichen gibt es von VW einen Schrieb. So kenne ich das zumindest von anderen Motoren.