Wie du den Woofer einbaust ist egal, ob normal oder invers... Der Unterschied ist zu 99% optischer Natur. Wenn du ihn invers verbaust solltest du ihn allerdings verpolt anschließen damit die "Gesamtpolung" wieder stimmt.
Das Reflexrohr kannst du eigentlich hinsetzen wo du willst, es kann sogar aus dem Gehäuse heraus stehen. Aber nicht vergessen, wenn das Rohr im Gehäuse steckt, geht das vom Volumen ab. Hinter dem Rohr sollte außerdem genug Platz sein für vernünftige Luftzirkulation... Also ein 10cm Rohr nicht 2cm vor der Rückwand enden lassen

Gehäuseform ist auch egal, Hauptsache dicht und das Volumen kommt hin.